Desde su niñez estuvo muy unido a la congregación salesiana, por haber estudiado en instituciones educativas de seguidores de Don Bosco en su ciudad natal y prosiguió con sus estudios religiosos en la Argentina.
Estudió Derecho en la Universidad Nacional de Asunción, además de Derecho Canónico en Roma.
Así también curso algunos estudios en España y fue miembro de la Academia Paraguaya de la Historia y doctor (HC) por la Universidad Católica «Nuestra Señora de la Asunción».
En tanto que en Argentina estudió noviciado y filosofía, en Córdoba se formó en Teología y fue ordenado sacerdote el 30 de noviembre de 1968.
Se destacó como docente y director de varios colegios salesianos, y fue reconocido como autor de varios libros.
El velorio del padre Carlos Heyn será en la capilla de Betania.
El domingo a las 15:00 se oficiará la misa de sepelio en el templo parroquial Domingo Savio.
El padre Heyn falleció a los 80 años en la Casa de Descanso Sacerdotal, según reportes del diario Abc.
